组织结构
联盟中方、东盟各设置一个常设主席单位，负责起草联盟内部制度、制定工作计划、推进工作进度，组织协调所在方联盟成员行政事务，与对方主席单位共同管理联盟日常事务。常设主席由常设主席单位的一位校领导担任。中方为天津大学，东盟方面为泰国玛希隆大学。
常设主席单位下设常设秘书处，负责整理联盟文书，发布联盟信息，执行联盟决议，以及组织、管理、协调联盟内各项事务；维护综合信息服务平台，发展国际工程教育战略联盟和工作网络，为联盟发展提供团体性支持框架。
联盟设置一个轮值主席单位，一般由中方、东盟成员高校轮流担任，负责根据联盟工作计划，组织年度联盟成员大会，组织、实施、协调联盟各项活动，争取各类外部资源支持联盟活动，汇报联盟年度工作进展。轮值主席由轮值主席单位的一位校领导担任。
联盟的首届轮值主席单位由常设主席单位兼任；若一方轮值主席单位轮空，由该方常设主席单位兼任。